科學追求瞬間結果，時間越短的結果離真理越近。因為科學的這類瞬間結果控制因素嚴格，只要遵循這種原則，不同瞬間的結果就會完全一樣，可以重復。而醫學所見的瞬間表現形式不一，而且隨時會發生變化，經常難辨是非，經常出現Yes中有No，No中有Yes。在臨床上，X光片上出現的異樣病灶，病理切片上表現的異型細胞，心電圖上表現的異常T波，都是在瞬間捕獲到的異常現象，但要肯定是什么病有時很難，因為經常會出現異病同影或同病異影。這時醫生除了再作一個加強顯影或分子顯像外，最好的辦法是等等看。當然這個“等等看”有時會使病人付出代價，比如疾病加重、腫瘤轉移甚至死亡，這也是醫學遠比科學難的地方。有時醫生為了不耽誤病情，常常開展實驗性治療，當然這樣做，病人可能花費多甚至被誤治，但面對醫學中這種瞬間發現與長期結果不一致的局面，醫生也是不得已而為之。
九，直接與間接間的關系不同科學通常研究事物間的直接聯系，習慣回答種瓜得瓜、種豆得豆。
而醫學常常碰到“種瓜不得瓜”、“種豆不得豆”，或“種瓜得了豆”，也就是醫學除了要回答直接問題外，更重要的是要回答間接問題。最近在我會診的某醫院發現了兩個疑難病例，一個病人因進行性吞咽困難一月余入院，最后連水都咽不下去了，四次胃鏡發現食管下段梗阻越來越重，但每次都未發現癌細胞。這個病人同時伴有雙肺結核，Tspot高數十倍（高度提示結核），胸片提示左側胸腔積液伴左下肺肺不張，血中CEA達256u，胸水CEA達2450 u，請我會診確診食管病變是結核還是腫瘤。最后我認為是左下肺癌伴左胸腔及食管周圍組織轉移，所謂的肺不張其實是肺癌組織。這例病人就是因為經治醫生單用科學的直接認識法而被誤診，而我是用醫學的間接認識法解決了這個問題。還有一例病人是全身水腫入院，既有凹陷性，又有黏液性，醫生考慮過甲減診斷，但病人的甲狀腺素不但不低反而還有增高，最后病人出現多臟器衰竭，特別是心衰，已由心內科開轉診單轉入該科ICU治療。我看過病人認為可以確診甲減，靠兩點間接證據，一是每天下午病人的體溫只有35.2℃，現在好多醫院都是電子病歷，不像過去把體溫單放到首頁，醫生也不去看，護士只報體溫高，不報體溫低；再就是這個病人雖然甲狀腺素正常，但那可是在TSH即促甲狀腺素增高3倍情況下才正常的，說明她的絕對值是低的。最后這個病人確診甲減，用甲狀腺素治療兩周后便痊愈出院。這例病人也是因為經治醫生單用科學的直接認識法而被誤診，而我是用醫學的間接認識法解決了這個問題，可見間接認識法在醫學上，特別是在臨床醫學實踐中有多么重要。
十，科學的必然性與醫學的偶然性，科學研究的結果通常是揭示事物的必然性。
科學追求的是白或黑，要不是白，要不是黑，但其實這個世界上單純的黑和白是很少的，更多的是灰，是黑白相間。醫學研究的是灰，難有單純的黑和白，這樣就會出現大量的科學規律以外的東西，這就是偶然性。這種偶然性對醫學十分重要。諾獎獲得者雅克•莫諾說過，“生物學界正是其偶然性成了每一次革新和所有創造的唯一源泉。”人體為何會出現那么多偶然性呢？因為一種疾病的病因可以千奇百怪，病態千形萬狀，病征千變萬化，醫生治病又千方百計，所以鑄成了臨床狀況中大量的例外及意外。就一個醫學研究者來說，能發現和闡明例外和意外者為高人；就臨床醫學工作者來說，能發現和處理例外和意外者為能人。醫學上的偶然性即例外和意外是經常發生的，這當然給我們醫生提供了發現和發明的絕好機會，但同時又增加了我們醫生的工作難度，所以社會需要對醫學和醫生寬容。
十一，生理與心理間的聯系科學通常對生理現象十分重視，而醫學在高度關注生理現象的同時，更強調心理對生理的影響，比如體外培養的癌細胞基本上像一個離開人體的單細胞生物，不受任何心理的影響，而當其在體內時或將其放回體內時，它的各種生物學行為包括生長、分化、轉移、耐藥等都受到心理影響。
在我們消化界有一位老前輩，還曾在一起開會談笑風生，回家后不到五天就病故了。為什么呢？回家做B超發現了胰腺癌，因為是自己專業，知道胰腺癌病人一般存活不到一年，更是惶惶不可終日，不吃不喝，坐臥不安，只生存了五天，其實是嚇死的。如果這個病人不是消化專業的或不知道患的什么病，可能再活幾個月是毫無問題的。講這么多，就是要說明科學在體外沒有心理活動的實驗，所獲得的結果對有心理活動的人體來說僅為參考。國外有一位教授是搞性心理的，這是一個非常難以研究的問題，就像兩個黑箱，一邊是性活動涉及到的大量的生物學分子，一邊是性活動也涉及到的大量的社會學因素，兩個黑箱在一起，哪個生物分子與哪個社會因素相關，哪群生物分子與哪些社會因素相關，是難以研究透徹或準確的。因為對人研究困難，他們選擇了比較簡單的果蠅，不太涉及到復雜的心理。研究成果不錯，發表了大量頂尖雜志的文章。但是果蠅跟人是不一樣的，比如兩對果蠅，在光天化日且眾目睽睽之下它們也會發生性活動，因為它們不知廉恥。而如若有兩對夫婦，你不將他們分開來住，或即使將他們分開來住，如果墻壁隔音不好，都會影響他們的言行。因為他們是人，他們有嚴格的道德規范，有復雜的心理活動，心理活動不僅受生物分子的影響，也影響生物分子發揮作用，其實對人的生老病死的研究及其結果也與此相似。
十二，客觀與主觀的并用，科學講究客觀事實，研究客觀事實，得到客觀的結論。
而醫學研究的對象是人，人與人之間通常有交流，會對同一事物產生不同的看法，難說誰對誰錯，這就是主觀。醫學不僅要觀察客觀，更重要的是認識客觀。因此，沒有主觀認識不成其醫學，也不能成就醫生。有位工程院院士患了胃癌，我為他在某醫院找了高級醫生，住了高級病房，結果當天晚上他擅自跑了，而且是和夫人一起跑的，我跟他夫人打電話問為何跑了，回答是他們問醫生胃癌有沒有自己好的，回答有！但很少。他們就認為自己是那一小部分人，結果他一年半以后就發展成晚期不治而離開了我們，年僅67歲，這就是因為他不能正確地認識客觀事物。好多人談癌色變，其實的確有自身恢復的，有的人醫生不告訴他，他可能會活十幾年甚至幾十年，即便是到了晚期，也有存活很長時間的。我在上海某大學有一位老師，發現肝癌時胸水里就有大量轉移癌細胞，通過整合醫學方法最后活了12年。在重慶某大學我有一位外科同行，發現胃癌時腹腔已轉移有大量印戒細胞，惡性程度很高，當時請我會診，我就兩點意見，一是回家吃好的，因為醫療上已無辦法；二是為科里找好接班人。接班人倒是找好了，可15年過去了，他現在還在，最后接班人等不及，調到另一所大學的附屬醫院去工作了。因此，什么是正確的醫學態度？就是要用科學態度正視癌的客觀存在及不同轉歸，同時又要用醫學態度正視個人的不同情況及珍惜難得的治療機會。另一位工程院院士在我們醫院做了腸鏡下大腸息肉切除手術，發現有腺瘤樣病變，這種病變的癌變率達30%，但因為已經切除了，所有沒有什么問題了。不過我告訴他一年后來復查腸鏡，可他回家才三天就給我打來電話，說還過362天就要來復查，問我這段時間要注意些什么。過了10天，他又打電話來說還過355天就來復查，問我特別要注意些什么。我勸他不要這樣緊張，思想要放松，不然會想出來一個腸癌的呢。不信大家想一想，在你的右腳大拇趾底部正長著一個黑色素瘤，你不要去檢查，就這么一直想，天天想，最后將會發生什么呢？神經體液會高度集中調控某一局部，形成惡性刺激，難免導致局部增生，真長出一個腫瘤來。因此，前面講的那位院士是太醫學就不科學，而后一位院士則是太科學就不醫學。
十三，數據與事實之別科學講求數據，凡事要以數據說話。
醫學也講求數據，但更講求事實，因為很多醫學數據并不完全等同于病人的實際情況，而一個真實的醫學事實是若干數據共同反映的結果，而絕非是一個數據的有無或高低所導致的結果。現代科學已經積累了海量數據，人稱大數據，但是大數據并不一定代表事實，有時由于數據的局限性，還可誘發誤診甚至引發災難。最近中國疾控中心與香港大學李嘉誠研究所和美國的NIH合作，針對手足口病在Lancet上發表了一篇論文，用了700多萬例資料，但其結論居然被廣州婦幼保健院幾名醫生用70多例的病例給否定了。試想，你一個人得了病，我用700萬例病人的數據算出的結果給你治病，可行嗎？可以嗎？可靠嗎？告訴大家，我的空腹血糖多年來都是7umol/L，那時正常值是4?6umol/L，好多人勸我去吃降糖藥，科學降糖，我就不去吃，為啥？我其他各項指標都正常，光把糖降下來或許是有害的呢。再說，我之所以60多歲了還反應敏捷，口若懸河，靠的說不定就是這個7umol/L啊，如果你給我降到5umol/L，成了低血糖，我不完了嗎？再說，最近學術界看到血糖高的人多了，已把正常值調到7umol/L，這下我真的回到正常了，其實我本身就是正常的啊！還有我的血小板，從來就是6萬/mm3，按有些人說法必須去打生長因子或吃生花生皮補啊，我從來不補，因為我媽給我的血小板就是6萬/mm3，個個管用，從不出血，你要給我升上去，超過正常下限，我說不定可能形成血栓引起心梗呢。還有血壓，都說120/80mmHg最正常，那你看跟誰算呢？70／80歲的人我就主張高一點，收縮壓最好到150／160mmHg，不然腦動脈供血不足對全身危害更大。有時我給老齡病人查房，血壓120/80mmHg，躺下時十分清醒，還給我講雞毛信、地雷戰，等到開飯，扶他坐起，連打哈欠，一下睡著了。為什么，血壓偏低，腦動脈供血不足啊。如果要追求數據，一個人有成千上萬個細胞，一個細胞有成千上萬的分子，一個分子一天在成千上萬秒時間內發生變化，三者相乘除以一個個體那可是無窮大的數據，真是“數據復數據，數據何其多，哪個更真實，誰也不好說”。作為醫學工作者，你究竟是相信這些無窮大的科學數據呢？還是相信符合實際的醫學事實呢？答案是肯定的。
十四，證據與經驗的關聯科學講求證據，凡事要證據說話，而醫學在講求證據的同時更講究經驗，因為經驗能治好病人。
一個經驗是若干證據相互組合，并經實踐反復證實的結果。如果只按證據治療，那是要出人命的。因為很多證據來源于局部、瞬間、間接，代表不了事物的本質。比如發燒和疼痛都是表面證據，其后潛藏著危險的病因或病變，退燒止痛只圖一時效果，最后可能延誤病情，造成不可彌補的損失。到急診室去看病，你一定要找那些“冷若冰霜”的醫生，他是胸有成竹，因為叫痛的病人不一定重，而沉默不語者很可能是病入膏肓了。最好不要找那些來回跑、你在急她也急的醫生，她其實是在找證據，其實她是看不出病，拿不出招啊。醫生要獲得經驗是很困難的，有的需要幾十年磨練，這就是為什么醫生越老越值錢。要做好的醫生一定要跟著老師學，而且不只是跟一個老師學，要跟著多個老師熬更守夜，摸爬滾打才能練出來。光會背書、光會記數據、光會找證據，其實未必能看好病。